Еще в прошлом веке к эпигенетике относились с настороженностью. Рассказываем, как из такого положения эпигенетика стала передовой наукой, как именно клетки передают наследственную информацию, не закодированную в ДНК, и как работают эпигенетические часы.
Содержание
Из сомнительной теории в передовую науку
Многие знают еще со школы, что наследственная информация закодирована в ДНК, которую клетки и организмы передают из поколения в поколение.
На этом основана теория эволюции: врожденные (закодированные в ДНК) признаки наследуются, а приобретенные, наоборот, не передаются потомству. По крайней мере, так считалось до середины прошлого века, пока не появилась эпигенетика – наука о наследовании признаков, не связанных с последовательностью ДНК.
Сейчас эпигенетика – одна из самых популярных областей биологических исследований.
Доказано, что эпигенетические механизмы влияют на старение , развитие разных заболеваний и даже поведение.
Однако, когда эпигенетика только появилась, к ней относились настороженно – направление критиковали такие известные генетики, как Ричард Докинз или Сергей Инге-Вечтомов.
И их можно понять – ведь наследование вне ДНК не укладывается в синтетическую теорию эволюции. Кроме того, с появления в 1942 году, термин «эпигенетика» даже не имел четкого определения.
Первые идеологи эпигенетики толком не могли объяснить, какие именно «негеномные факторы» могут наследоваться и влиять на работу организма.
Только через пару десятков лет после появления эпигенетики ее последователями удалось убедить все научное сообщество: эпигенетика – не лженаука, а последовательная и обоснованная теория.
Одной из первых работ, подтверждающих эпигенетические эффекты, стало исследование Роберта Уотрелэнда и Рэнди Джиртла из университета Дюка.
Они кормили мышей пищей, богатой метильными группами, и выяснили, что у их потомства шерсть другого цвета – коричневая вместо желтого.
Однако мыши были генетически идентичными – то есть метил-обогащенная пища повлияла на внешний вид мышей в обход последовательности ДНК. Оказалось, во всем виновато метилирование так называемого гена агути, который и отвечает за желтый цвет.
Загадочные негеномные факторы
После работы Уотерлэнда и Джиртла, а также целой серии других исследований, наконец удалось определить загадочные «негеномные факторы».
Ими оказались метилирование и другие химические модификации ДНК и ее структурных и регуляторных белков.
ДНК метилируется ферментом метил-трансферазой и в строго определенных местах – CpG-островках. Фермент находит этот двухнуклеотидный сайт и навешивает на цитозин метильную метку — СН3.
Существуют и другие ферменты, способные навешивать метки не на сами нити ДНК, а на упаковочные белки – гистоны. Эти белки нужны, чтобы «намотать» на них длинные нити ДНК как на катушку, и образовать сложную 3D-структуру клеточного генома.
Но как эти метки связаны с генами и наследованием?
Оказывается, метильные и другие метки могут «сигнализировать» клетке об активности гена.
Так, например, метилированные участки обычно неактивны – гены в них сохраняют свою структуру, но перестают работать.
Считается, что ферменты транскрипции, которые и «считывают» гены, хуже распознают метилированные последовательности и не садятся на них. Но есть и активирующая метка – ацетилирование аминокислот в гистонах.
Ацетильная метка «снимает» положительный заряд с поверхности белка, из-за чего комплекс дестабилизируется и закрытая компактная ДНК открывается и становится доступной для ферментов.
Таким образом, клетка способна делить участки ДНК на активные и неактивные, не вмешиваясь в саму последовательность.
В результате генетически идентичные клетки или организмы начинают функционировать по-разному.
Эпигенетические часы
Одна из самых интересных областей эпигенетики — эпигенетика возраста.
Эпигеном клетки, то есть совокупность меток ДНК и модификаций гистонов, соответствует возрасту клетки.
Впервые таким образом измерять возраст предложил в 2013 году Стив Хорват — биоинформатик из Калифорнийского университета.
Он создал модель машинного обучения, которая предсказывает возраст по совокупности метильных меток. Он обучил ее на общедоступных данных о метилировании в тканях и определил участки генома, метилирование которых достоверно соответствует возрасту.
Сейчас начинают появляться и работы по изменению эпигенетического возраста через воздействие на эпигеном.
Так, группа исследователей из Лос-Анджелеса попробовала «омолодить» иммунную систему девяти волонтеров.
Участники регулярно принимали гормон роста для увеличения числа лимфоцитов, а также препараты для устранения побочных эффектов гормона: метформин от диабета и дегидроэпиандростерон от воспаления.
Так удалось не только нарастить количество иммунных клеток и частично восстановить тимус, но и снизить эпигенетический возраст пациентов.
Согласно эпигенетическим часам, они стали моложе, чем во время начала эксперимента. Правда, пока рано говорить об эпигенетическом омоложении человека – ведь эксперимент длился всего около года и был нацелен только на иммунные клетки, а не на все тело.
Однако возраст – далеко не единственная область, тесно связанная с эпигенетическими механизмами.
Эпигенетика влияет и на внутриутробное развитие, поведение, здоровье.
Описать все эпигенетические механизмы в одной статье сложно, но одно сказать можно с точностью: переоценить их значение для наследования почти невозможно.
Сами гены, которые отвечают за кодирование белков, составляют только 1–3% ДНК человека. Остальная часть ДНК только контролирует активность генов, выполняет другие функции, а некоторые последовательности и вовсе ни за какие процессы не отвечают.
Проявление многих генетических признаков зависит от внешних факторов: питания, образа жизни и окружающей среды.
Взять здоровье под контроль и узнать, как ваша ДНК и образ жизни влияют на организм, можно с помощью генетических тестов Атлас.
Вы получите знания о том, как генетика влияет на риски развития многофакторных и наследственных заболеваний и получите персонализированные рекомендации по анализам и врачам, питанию и образу жизни. С их помощью вы сможете грамотно управлять своим здоровьем и планировать семью.
Больше интересных статей в блоге Атлас:
- Science Advances, Epigenetics and aging, 2015
- Cell, Cancer epigenetics: from mechanism to therapy, 2012
- Wiley Interdiscip Rev Syst Biol Med., Behavioral epigenetics, 2016
- Molecular and cellular biology, Transposable Elements: Targets for Early Nutritional Effects on Epigenetic Gene Regulation, 2003
- N+1, Эпигенетическое старение человека впервые удалось обратить вспять, 2019
- Nature, CANALIZATION OF DEVELOPMENT AND THE INHERITANCE OF ACQUIRED CHARACTERS, 1942
- Биомолекула, Эпигенетика: невидимый командир генома, 2015